Blog Najnowsze artykuły dla kategorii Mikrobiom
11 września 2018
Jednym z niepożądanych działań antybiotyków jest niszczenie naturalnej, dobroczynnej flory bakteryjnej organizmu. Szczególnie zagrożona jest flora kolonizująca jelita, zaś jej zaburzenia mogą objawiać się między innymi wzdęciami, bólami brzucha, wymiotami lub tak zwaną biegunką poantybiotykową, występującą aż u średnio 20% pacjentów w trakcie czy też po antybiotykoterapii. Aby zniwelować niepożądane objawy, stosuje się mieszanki bakterii zwane probiotykami.
BioMeta16S
Mikrobiom
NGS
27 sierpnia 2018
Historia uczy nas, że potencjalne zastosowanie bojowe może być dla nowej technologii doskonałym motorem postępu. Nie dziwi więc, że dokonania biotechnologii z ostatnich dekad, a w szczególności rozwój technik sekwencjonowania informacji genetycznej, rodzą wątpliwości natury etycznej. Łatwo bowiem wyobrazić sobie zastosowanie tych technologii do wytworzenia nowej odmiany broni biologicznej.
Mikrobiom
Wirusy
22 października 2017
Analiza 16S jest szeroko stosowana w identyfikacji mikroorganizmów – bakterii, archeonów - oraz poszukiwaniu powiązań filogenetycznych między nimi. Polega na amplifikacji i sekwencjonowaniu genu 16S, charakteryzującego się wysokim polimorfizmem pomiędzy różnymi gatunkami tych mikroorganizmów. Gen 16S podzielony jest na kilka rejonów: V1 do V9, których amplifikacja zachodzi dzięki uniwersalnym starterom. Amplifikacja dwóch rejonów 16S (np. V3V4) jest wystarczająca do identyfikacji większości bakterii, jednak im dłuższy fragment jest amplifikowany tym łatwiej jest rozróżnić mikroorganizmy o wysokim stopniu podobieństwa. Ma to duże znaczenie zwłaszcza na etapie identyfikacji bakterii do poziomu taksonomicznego gatunku.
BioMeta16S
Mikrobiom
NGS