Blog Najnowsze artykuły
3 stycznia 2018
Sekwencjonowanie fragmentów DNA rozpoczęło się w roku 1977, kiedy po raz pierwszy pojawiła się publikacja opisująca nową metodę określania sekwencji nukleotydowych w DNA. Autorem innowacyjnej metody był Frederick Sanger, który do dnia dzisiejszego określany jest mianem niemal ojca sekwencjonowania a jego metoda - złotym standardem. Wspomniana publikacja uzyskała ponad 70 tysięcy cytowań, a opisana w niej metoda jest szeroko stosowana na całym świecie. Wraz z pojawieniem się metody sekwencjonowania Sangera pojawiły się pomysły na nowe technologie, które w dzisiejszych czasach pełnią dużą rolę na rynku sekwencjonowania DNA. W niniejszym artykule skupiliśmy się na pokazaniu poruszonych w artykule Nature aspektów i możliwości wykorzystania sekwencjonowania DNA i ich konsekwencjach w różnych dziedzinach naukowych i społecznych.
DNA
Mutacje
NGS
4 grudnia 2017
Naukowcy z USA, Francji, Norwegii i Singapuru opublikowali artykuł, w którym określili genetyczne pochodzenie Yeti. Analizie poddano 9 próbek pochodzących z włosów i zębów stwora. Wyniki pokazały, że próbki nie pochodzą od ogromnego hominina, ale w rzeczywistości w większości należały do niedźwiedzi. Jedna próbka sprzeciwiła się temu trendowi - stwór okazał się hybrydą z włosami niedźwiedzia i zębami psa.
DNA
22 października 2017
Analiza 16S jest szeroko stosowana w identyfikacji mikroorganizmów – bakterii, archeonów - oraz poszukiwaniu powiązań filogenetycznych między nimi. Polega na amplifikacji i sekwencjonowaniu genu 16S, charakteryzującego się wysokim polimorfizmem pomiędzy różnymi gatunkami tych mikroorganizmów. Gen 16S podzielony jest na kilka rejonów: V1 do V9, których amplifikacja zachodzi dzięki uniwersalnym starterom. Amplifikacja dwóch rejonów 16S (np. V3V4) jest wystarczająca do identyfikacji większości bakterii, jednak im dłuższy fragment jest amplifikowany tym łatwiej jest rozróżnić mikroorganizmy o wysokim stopniu podobieństwa. Ma to duże znaczenie zwłaszcza na etapie identyfikacji bakterii do poziomu taksonomicznego gatunku.
BioMeta16S
Mikrobiom
NGS
27 września 2017
Naukowcy z NIH (National Institute of Health) przebadali wszystkie 24 chromosomy człowieka i zidentyfikowali dodatkowe tzw. Rzadkie Autosomalne Trisomie (RAT). W badaniu wzięła udział grupa składająca się z 90 000 próbek osocza krwi matek: 72 000 z USA i 18 000 z Australii. Wyniki opublikowane zostały w czasopiśmie Science Translational Medicine.
Badania prenatalne
DNA
Mutacje
NGS
12 września 2017
System CRISPR to metoda obronna organizmów prokariotycznych (archeonów i bakterii) przed "obcym" materiałem genetycznym np. plazmidami czy bakteriofagami. Jest to swego rodzaju system immunologiczny mikroorganizmów, którego działanie polega na rozpoznaniu "obcego" materiału genetycznego w komórkach i zniszczeniu go poprzez cięcia nici DNA za pomocą enzymów zwanych nukleazami (np. Cas).
CRISPR-Cas
DNA
Mutacje
24 sierpnia 2017
Powstanie szczepionki RNA pozwoliło zwalczyć wirus Zika, jednak jej produkcja jest długim i skomplikowanym procesem. Niezależnie od przeszkód preparaty te dają nadzieje na skuteczną walkę z rakiem.
Nowotwory
Projektowanie leków
RNA
Szczepionki
